Ah oui en effet, le premier média n'est pas une "entité média" (c'est pour cela qu'on ne peut pas le fusionner) mais un media intégré dans la fiche de l'individu. (c'est ce que signifie "l'entité porteuse n'est pas une entité média").
Dans ce cas, il faut en effet supprimer l'étiquette OBJE correspondante depuis l'éditeur Gedcom. Clic-droit, Supprimer. Et rajouter le média, soit depuis l'éditeur Gedcom avec clic-droit sur l'événement voulu ou l'individu/"Ajouter un média", ou bien depuis Cygnus en cliquant sur une photo et en faisant ajouter un média et le choisir dans la liste des médias "existants", ce qui évite les doublons.
Explication de la situation:
Il y a deux façon de rattacher des médias à un individu ou un événement: dans les 2 cas c'est avec une étiquette OBJE, mais dans 1 cas, après OBJE il y a l'identifiant de l'entité média qui porte le fichier avec une étiquette FILE dedans, dans l'autre cas il n'y a pas d'entité Média et le FILE est directement sous l'OBJE.
(c'est ce que la norme Gedcom dit, ce n'est pas propre à Ancestris).
Avec Ancestris, on recommande de ne faire que le premier cas, et c'est ce que Cygnus fait.
En espérant que ce soit plus clair comme cela.